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《自然》子刊:新方法可使小型DNA测序仪达到近乎完美精度

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本周发表在《自然方法》(Nature Methods)的一项研究显示,研究人员找到了一种简单的方法来消除几乎所有由广泛使用的便携式DNA测序仪产生的测序错误,这可能使在实验室外工作的科学家能够更有效地研究和跟踪病毒等微生物。

使用特殊的分子标签,该团队能够将牛津纳米孔技术公司(Oxford Nanopore Technologies)的测序设备MinION的错误率由5%~15%的降低到0.005%以下。

基因组序列可以揭示生物体的很多信息,包括身份、祖先以及它的优势和弱点。科学家利用这些信息来更好地理解生活在特定环境中的微生物,以及开发诊断工具和治疗方法。

但是如果没有精确的便携式DNA测序仪,当在野外或较小的实验室进行研究时,关键的遗传细节可能会丢失。

因此,研究人员创造了一种独特的条形码系统,可以使像MinION这样的测序设备准确性提高1000倍以上。

在用这些条形码标记目标分子后,研究人员使用标准的聚合酶链反应技术扩增或复制标记的分子,并对所得的DNA进行测序。

然后,研究人员可以使用条形码轻松识别和分组测序数据中的相关DNA片段,最终可得到近乎完美的序列。

研究人员表示,这一方法在任何结合高精度和远程基因组信息的领域,如癌症研究、植物研究、人类遗传学和微生物学都非常有用。

编译/前瞻经济学人APP资讯组

论文链接:

https://www.nature.com/articles/s41592-020-01041-y

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